除了基因失活外，还有一个原因是药物残留。
很多人疑惑，为什么表面看起来光鲜亮丽的西红柿也容易农药残留呢？这是因为西红柿生长在大棚里，它的花蕊不能正常授粉、结果，所以菜农一般都会在雌花蕊上点一些生长调节剂，这样它才能长出西红柿来。此外有时候催熟不是摘下来才催熟，而是在西红柿生长阶段就催熟。
这样种植长出来的西红柿常常会出现不同形状的畸形，有些长出尖尖的桃尖儿，有些却长得有棱有角。专家介绍，这样出来的西红柿它的内部都应该是“空”的，或者是没有籽的！而正常生长的西红柿，内部不仅饱满，而且多籽多汁。
此外，还有一种西红柿切开后虽然没有空心，但颜色却不正常，这些西红柿用了催熟剂（乙烯利），外表是红的，内部却是绿的。因为这些农药不可能完全渗透到里面去，所以“外红里绿”。
专家提醒：挑选西红柿时，要选择外表圆圆润润的，表面有像沙瓤一样的小白点，尾部有一点点裂纹的，这样的说明西红柿才是自然生长成熟的。
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